Pathogen | Strain | Name | Uniprota | Primer sequencesb | Mutagenesis primerc | Reference |
---|---|---|---|---|---|---|
Helicobacter pylori | Hp26695 | HtrA | G2J5T2 | 5′-AAGGATCCGGCAATATCCAAATCCAGAGCATG-3′ 5′-AAGAATTCGACCCACCCCTATCATTTCACC-3′ | 5′-GCTTCCATCAATCCTGGAAATGCTGGCGGCGCTTTAATTGATAGC-3′ 5′-GCTATCAATTAAAGCGCCGCCAGCATTTCCAGGATTGATGGAAGC-3′ | [25] |
EPEC | E2348/69 | DegP | B7UIK8 | 5′-GGATCCGCTGAGACTTCTTCA-3′ 5′-CCCGGGTTACTGCATTAACAG-3′ | 5′-CAACCGGGGTAACGCAGGTGGTGCGTTG-3′ 5′-CAACGCACCACCTGCGTTACCCCGGTTG-3′ | [15] |
DegQ | B7UJW6 | 5′-GATCGGATCCATTCCAGGCCAGGTTGCCGC-3′ 5′-CTAGCTCGAGTAACGCATTAGTAGGTAGAG-3′ | 5′-CATTAACCGCGGTAACGCCGGCGGTGCACTGTTAAAC-3′ 5′-GTTTAACAGTGCACCGCCGGCGTTACCGCGGTTAATG-3′ | This work | ||
DegS | B7UJW7 | 5′-GATCGGATCCAGCCTTAACCCGCTTTCCAC-3′ 5′-CTAGGAATTCTTAGTTGGTCGCCGGATATT-3′ | 5′-CCATTAACCACGGTAACGCTGGCGGCGCGCTGG-3′ 5′-CCAGCGCGCCGCCAGCGTTACCGTGGTTAATGG-3′ | This work | ||
Salmonella Typhimurium | NCTC 12023 | HtrA | P26982 | 5′-GATCGGATCCGCTGAAACGTCCTCTTC-3′ 5′-CATGCTCGAGTTACTGCATCAGCAAATAAATAG-3′ | 5′-CCGTGGTAACGCCGGCGGCGCGCTGG-3′ 5′-CCAGCGCGCCGCCGGCGTTACCACGG-3′ | This work |
Yersinia enterocolitica | ATCC 27729 | DegP | P74978 | 5′-GATCGGATCCCCGGTTTCTTCTGTCGTTGC-3′ 5′-CTAGGAATTCTTACTGCATCAGCAGATAGAG-3′ | 5′-GCAATTAACCGTGGTAACGCCGGTGGTGCATTGATCAATC-3′ 5′-GATTGATCAATGCACCACCGGCGTTACCACGGTTAATTGC-3′ | This work |
Proteus mirabilis | ATCC 29906 | DegQ | B4EXL6 | 5′-GGATCCGCCCTGCCTTCGGTAA-3′ 5′-GAATTCTTAACGCGAGCTGTTACGTAA-3′ | 5′-GCATCAATTAACCGTGGTAACGCTGGTGGTGCTTTAGTTAATC-3′ 5′-GATTAACTAAAGCACCACCAGCGTTACCACGGTTAATTGATGC-3′ | This work |
DegS | B4EXL5 | 5′-GATCGAATTCATGTTAAGCAAGCTACTGCG-3′ 5′-CTAGCTCGAGCTATGACTCTGGCTGATATT-3′ | 5′-CAATTAATGAAGGAAATGCAGGGGGGGCACTGATTAATACTG-3′ 5′-CAGTATTAATCAGTGCCCCCCCTGCATTTCCTTCATTAATTG-3′ | This work |